суббота, 25 января 2014 г.

Участки CRISPR и механизмы специфической защиты у бактерий

Бактерии могут приобретать передающуюся в дальнейшем по наследству устойчивость к инфекции бактериофагами, обусловленную встраиванием ДНК фага в геном бактерии. Существуют и другие пути защиты от фагов, например система рестрикции/модификации генома, уничтожающая неметилированную чужеродную ДНК, ингибирование адсорбции за счёт изменения структуры поверхностных рецепторов, ингибирование инъекции генетического материала или литической инфекции. Короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами (Clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR) – геномные последовательности прокариот, обеспечивающие специфический иммунитет к определённому виду фагов, в них встраиваются чужеродные последовательности, которые помогают распознать фаг при повторном заражении и предотвратить развитие инфекции. CRISPR сохраняет информацию о прошлых встречах с фагами. Почти в половине изученных бактериальных геномов и 85% исследованных геномов архей обнаружены компоненты этой системы.

воскресенье, 19 января 2014 г.

LncRNA - ещё один путь регуляции биологических процессов

До 73% генома дрожжей S. cerevisiae кодирует белки, у дрозофил на долю кодирующих последовательностей приходится уже всего 18% генома, а у млекопитающих кодирующие последовательности – это всего 2–3% геномной ДНК. Остальная часть генома – это различные некодирующие последовательности, в том числе длинные некодирующие РНК – lncRNA. Общее количество lncRNA выше у млекопитающих, чем у более просто устроенных животных – нематод, насекомых, рыб. Размер больших некодирующих РНК >200 оснований, они могут включать тысячи оснований. LncRNA могут быть сходны (но не всегда) по структуре с матричными РНК и подвергаться кэпированию и полиаденилированию.

суббота, 11 января 2014 г.

Вирусы против вирусов или поиск вакцины от лихорадки Эбола

Вирус Эбола относится к семейству филовирусов и вызывает тяжёлое, в большинстве случаев, смертельное для человека заболевание, лихорадку Эбола. Его естественный резервуар – крыланы, родственники летучих мышей. Инфекция встречается на территории Центральной и Западной Африки, а также Филиппинских островов. Первая вспышка среди людей была зарегистрирована в 1978 году, и до 1994 регистрировалась в среднем одна вспышка в год. Первые попытки организовать вакцинацию против вируса Эбола были предприняты ещё в 80-ых годах прошлого века, однако поиски оптимального решения продолжаются и сейчас. На сегодня наиболее приемлемым сценарием вакцинации считается её применение для ограничения вспышки. В таком случае требуется вакцина, приводящая к максимально быстрому формированию иммунитета при однократной вакцинации. Желательно, чтобы она могла нормально храниться вне холодильника, что облегчило бы её доставку. Наиболее результативные в лабораторных испытаниях вакцины против вируса Эбола – рекомбинантные вирусы, в состав которых введён ген вируса Эбола GP.

пятница, 3 января 2014 г.

Астма - генетика и эпигенетика


Астма имеет сложную природу, её возникновение и развитие обусловлены сочетанием наследственных факторов и воздействия окружающей среды. Идентифицирован ряд хромосомных локусов, полиморфизм структуры которых может быть ассоциированы с астмой, в том числе регион ORMDL3 17q21, IL1RL/IL18R 2q, TSLP 5q22 и IL33 9p24. Полиморфизмы IL13, IL33 и его рецептора IL1RL1, генов главного комплекса гистосовместимости и TSLP связаны как с развитием астмы, так и с риском возникновения других аллергических заболеваний. В основном это гены, вовлечённые в работу иммунной системы, в частности ORMDL3 регулирует участие иммунных клеток в воспалении при аллергической реакции в дыхательной системе. Своеобразная «наследственность» астмы свидетельствует о немаловажном значении эпигенетических факторов в её развитии. Наличие астмы у матери является гораздо более значимым фактором риска, чем её наличие у отца, а также отмечено, что риск развития астмы может быть связан с воздействиями на плод до рождения.